Çocuklarda migren tedavisinde yalnızca ilaç düşünülmemelidir; çocuklarda “migren” genellikle bir ruhsal hoşnutsuzluk belirtisidir ve çocuğun çevre ile (aile, okul) ruhsal çatışmasının klinik görünümü olarak değerlendirilmelidir. Bu nedenle, ilaç tedavisine başlamadan önce, çocuğun ruhsal durumunu, çevresini incelemek ve bu alandaki olumsuzluktan değiştirmeye çalışmak gerekir.
Migrende ilaç tedavisi söz konusu olunca, akut nöbet tedavisi ve migren nöbetlerinin önlenmesi ayrı ayrı ele alınmalıdır.
Akut nöbet tedavisinde, daha iyi uyum gösterilenlere öncelik verilerek ağrı kesiciler kullanılır. Bu ilaçların olabildiğince çabuk, yani nöbet başlar başlamaz verilmesi gerekir. Bulantı ve kusmayı önleyecek ilaçlar da verilebilir. Ağn kesici tedavinin yanı sıra, çocuğun karanlıkta dinlenmesi ve rahatlaması da yararlı olabilir.
Migrende önleyici tedavi nöbetler çok sıklaştığı zaman (ayda 2-3 kez) uygulanır; temelde erişkinde uygulanandan farklı değildir, dozlar yaşa göre ayarlanır.